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學(xué)術(shù)討論
academic discussion

First-in-human immunomodulation mechanism research of chlorogenic acid in patients with recurrent high-grade glioma

來源:九章生物 發(fā)布日期:2018.04.27

這篇論文研究了綠原酸在復(fù)發(fā)高級(jí)別膠質(zhì)瘤患者中的人體免疫調(diào)節(jié)機(jī)制。

 

研究背景

 

1高級(jí)別膠質(zhì)瘤(包括膠質(zhì)母細(xì)胞瘤和間變性星形細(xì)胞瘤)在標(biāo)準(zhǔn)治療(手術(shù)切除和同步放化療)后預(yù)后仍然很差,幾乎所有患者都會(huì)復(fù)發(fā)。

2現(xiàn)有的抗血管生成藥物(如貝伐珠單抗)未能改善膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者的總生存期(OS),且對(duì)于復(fù)發(fā)或?qū)μ婺虬罚?/font>TMZ)耐藥的高級(jí)別膠質(zhì)瘤,標(biāo)準(zhǔn)治療無效。

3盡管免疫治療和靶向治療領(lǐng)域的新療法策略不斷增加,但仍急需有效的治療方法。綠原酸作為一種多功能的天然多酚化合物,具有抗腫瘤、神經(jīng)保護(hù)、抗炎、抗氧化等多種生物活性,但其抗腫瘤機(jī)制尚不明確。

 

研究方法

 

1、研究對(duì)象:在北京世紀(jì)壇醫(yī)院接受綠原酸治療的復(fù)發(fā)高級(jí)別膠質(zhì)瘤患者,共納入6例患者。所有患者在入組前均簽署了知情同意書。

2、樣本收集:在治療前和治療第15天分別采集患者的外周血樣本。使用RNA-seq技術(shù)對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序。

3數(shù)據(jù)處理:使用MATLAB軟件檢測(cè)差異表達(dá)基因(DEGs),并進(jìn)行京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路和基因本體(GO)功能分析。

 

實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

 

1樣本處理:從外周血白細(xì)胞中提取RNA,使用NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina制備cDNA文庫,并使用Illumina HiSeq 150儀器進(jìn)行測(cè)序。

2、數(shù)據(jù)分析:使用HISAT2進(jìn)行基因組比對(duì),FeatureCounts進(jìn)行基因計(jì)數(shù),計(jì)算每個(gè)基因的每千個(gè)轉(zhuǎn)錄本序列的片段數(shù)(FPKM)。使用MATLAB進(jìn)行差異表達(dá)分析,篩選出P值小于0.05且變化倍數(shù)(FC)大于2的基因。

3功能注釋:使用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行KEGG通路和GO功能分析,篩選出P值小于0.05的富集通路和術(shù)語。

 

結(jié)果與分析

 

1、研究發(fā)現(xiàn),綠原酸治療對(duì)部分患者(P3P4)有效,使腫瘤病灶縮小,達(dá)到穩(wěn)定疾病狀態(tài)(SD)。P3P4的無進(jìn)展生存期(PFS)分別為8.1個(gè)月和4.9個(gè)月,總生存期(OS)均超過16.5個(gè)月,且至今仍存活。

2、差異表達(dá)基因分析顯示,P3P4中共有269個(gè)基因上調(diào)和182個(gè)基因下調(diào),這些基因主要富集在與免疫系統(tǒng)相關(guān)的通路和術(shù)語中。例如,上調(diào)基因包括CD52CAMPATH-1抗原)、APOBEC3CDNA脫氨酶)和組蛋白H2B類型2-EHIST2H2BE),下調(diào)基因包括腫瘤壞死因子受體超家族成員10CTNFRSF10C)和GTP活性相關(guān)蛋白(如ARHGAP30RAC1)。

3、KEGG通路分析顯示,上調(diào)基因富集在Jak-STAT信號(hào)通路中,而下調(diào)基因富集在細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用和NF-κB信號(hào)通路中。GO術(shù)語分析顯示,上調(diào)基因涉及免疫調(diào)節(jié)、淋巴細(xì)胞分化和免疫反應(yīng)等多個(gè)過程。

 

P3和P4患者綠原酸治療前后的磁共振成像(MRI)圖像

 

總體結(jié)論

 

綠原酸可能通過改變基因表達(dá)水平,上調(diào)免疫系統(tǒng)活性,從而抑制腫瘤發(fā)展,使其成為一種潛在的抗腫瘤藥物。研究結(jié)果表明,綠原酸在復(fù)發(fā)高級(jí)別膠質(zhì)瘤患者中具有顯著的免疫調(diào)節(jié)功能,未來需要進(jìn)一步研究以深入理解其功能機(jī)制。

 

這篇論文通過高通量RNA-seq技術(shù),揭示了綠原酸在復(fù)發(fā)高級(jí)別膠質(zhì)瘤患者中的抗腫瘤免疫調(diào)節(jié)機(jī)制,為未來的臨床應(yīng)用提供了重要的理論依據(jù)。

 

 


文獻(xiàn)鏈接

First-in-human immunomodulation mechanism research of chlorogenic acid in patients with recurrent high-grade glioma
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